En conjunción con la clínica de medicina reproductiva, el Laboratorio de Endocrinología de la Reproducción (LER) ha centrado su interés en el estudio del control endocrino-molecular de la síntesis de hormonas esteroidales, específicamente del folículo ovárico y cuerpo lúteo humano. Recientemente ha iniciado estudios de desarrollo folicular normal y patológico como es el caso del Síndrome de Ovario Poliquístico, en este último se ha centrado en la importancia de la angiogénesis y metabolitos del estradiol sobre el arresto folicular. Además, estudia la regulación del receptor de progesterona en el periodo peri-ovulatorio y la importancia de factores inmunológicos sobre la receptividad uterina e implantación embrionaria. El quehacer de LER se enmarca en la formación docente de estudiantes de pre y post grado, investigación científica básica clínica y prestaciones asistenciales, en las áreas de endocrinología reproductiva, con la implementación de pruebas funcionales para uso diagnóstico, exámenes hormonales de rutina, marcadores tumorales y estudios citogenéticos de abortos espontáneos y líquido amniótico. Para la realización de estos objetivos el laboratorio trabaja en estrecha relación con la Unidad de Fertilización Asistida y el Laboratorio de Citogenética del IDIMI. Para el desarrollo de estas metodologías el laboratorio cuenta con equipos como: termociclador en tiempo real, microscopio de luz y epifluorescencia con software para análisis de imágenes, sistema de micro-disección láser (laser capture), campana de flujo laminar e incubadores para cultivo celular.